Previsão por EKL
Modelo da Análise: EKL Foi utilizado o modelo logístico referente aos dados de novos casos reportados:
\[ log (y) = r * t + b \] onde:
y é o número de novos casos
t é o tempo desde o início de observação do surto (em dias)
r é a taxa de crescimento por período de tempo t
b é o número de casos (escala logarítmica) no início do surto
É realizada diariamente uma actualização da previsão com todos os dados reportados disponíveis. A previsão efectuada do número de novos casos abrange a janela temporal desde o último dia de reporte e actualização dos dados - 1 dia.
Os valores apresentados como “Novos casos (modelo)” representam o número de casos estimados pelo modelo para uma determinada data observada. A diferenca entre este número e o valor efectivamente observado representará o erro do modelo.
Os valores apresentados como “Novos casos (previsão)” representam o número de casos previstos para o dia seguinte, em referência à última data de reporte de dados.
Tempo de duplicação
O tempo de duplicação de novos casos é obtido através da taxa de crescimento exponencial (r) calculada segundo uma regressão (modelo logístico) dos valores obtidos.
\[ \]
Rt
O número de reprodução efectivo no período temporal t (‘Rt)’) estima o número médio de casos secundários infectados por um caso durante o seu período infeccioso, para o período de tempo t. Sendo assim, este número mede a dinâmica de transmissão de uma infecção num período temporal específico.
Rt permite indicar o nível de transmissão da doença (se Rt estiver acima de 1, a transmissão está a decorrer a um ritmo elevado), bem como se esta se encontra em aceleração ou desaceleração, ao longo de um determinado período de tempo.
O período temporal de cálculo utilizado é baseado nos resultados dos últimos 5 dias.
Foi utilizado o método de cálculo de Rt de Milan Batista et. al.. O artigo está disponível em DOI: 10.1101/2020.03.11.20024901. Para o efeito, foram utilizados os valores reportados por Abbott S., et. al. - média de 4,7 dias (Intervalo de Credibilidade 95% [CrI 95% CrI]: 3,7 - 6,0) e desvio padrão de 2,9 dias (CrI 95% : 1,9 - 4,9)).
Os cálculos foram efectuados com o software Matlab, versão 2019b.
Os dados do novos casos por dia foram calculados com base no boletim diário da Direcção-Geral da Saúde.
Autores da análise
ED K Lindemann
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